【摘要】目的分析2002--2010年浙江省急性出血性结膜炎(AHC)暴发疫情病原柯萨奇病毒A组24型变种(CA24v)流行株的全基因组序列与遗传特性。方法选取浙江省不同年份的CA24v流行株,采用RT-PCR扩增基因序列,并与国内外流行株进行全基因组及VPl、3C区序列比较分析。结果浙江省2002年和2010年CA24v全序列为7456~7458bp,编码含2214个氨基酸残基的多聚蛋白,2010年的Zhejiang/08/10较2002年的毒株在5’端非编码区的第97、119位各存在一个T碱基插入,Zhejiang/08/10与2002年以来的分离株各区段氨基酸同源性为94.7%~100.0%,与近60年来CA24流行代表株全序列中各区段氨基酸的平均差异率以2A区与3A区最大,分别达8.4%和7.3%。3D区最小,仅为1.9%。1987年与2002年以来的CA24v毒株在全序列上共存在38个和20个氨基酸的稳定变异。2002--2010年CA24v的组间遗传距离分析表明,3c区较VPl区更为稳定,CA24v的早年流行株Jamaica/10628/87在3D区上可能存在重组,而在近年流行株中未发现该现象。结论CA24v以时间序列为主逐年进化,地域间虽存在差异,但影响较小。自2002年起,由CA24v引起的AHC一直在浙江省本地散在流行。
   
   【关键词】急性出血性结膜炎;柯萨奇病毒A组24型变种;全基因组序列分析;重组
   
   
   讨论
   当前CA24v已成为许多国家与地区AHC暴发和流行的主要病原体。近10年来,我国也多次发生CA24v引起的AHC较大范围流行,波及北京、浙江、广西、云南、海南和广东等地。AHC传染性强,且由于抗体在感染者体内持续存在时间不长,造成大量人群对AHC易感,导致不断发生暴发和流行。通常关于CA24v基因特性的研究,大多集中在VPl区与3C区上。本研究发现非结构区的2A区与3A区的氨基酸平均差异率,几乎是VPl区与3C区的2倍,此外部分CA24v毒株的3D区也发现重组。上述现象的生物学意义目前尚不清楚。